期刊简介
《临床医药实践》是由山西省卫生厅主管，山西医科大学第二医院主办，国内外公开发行的综合性医学学术期刊。本刊为中国学术期刊综合评价数据库统计源期刊，中国核心期刊(遴选)数据库收录期刊，中文生物医学期刊文献数据库收录期刊。
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首页>临床医药实践杂志
- 杂志名称：临床医药实践杂志
- 主管单位：山西省卫生厅
- 主办单位：山西医科大学第二医院
- 国际刊号：1671-8631
- 国内刊号：14-1300/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：中国期刊全文数据库(CJFD)期刊收录：上海图书馆馆藏, 知网收录(中), 维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 万方收录(中), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日)
小鼠舌癌模型差异基因的筛选及生物信息学分析
武媛；万晓文；王伟；蒋琳；邵益森；何露露
关键词：生物信息学分析, 差异表达基因, 舌癌
摘要：目的:对小鼠舌癌模型差异表达基因进行筛选及基因功能分析,为舌癌发病机制相关的分子标志物及药物靶点提供理论基础.方法:从高通量基因表达(GEO)数据库中选取GSE64271和GSE75421数据包,获取其中小鼠舌癌模型的芯片数据,分为舌癌组和非舌癌组,利用R语言的limma包分析筛选差异基因.利用DAVID和STRING数据库对差异表达基因进行基因本体论(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)基因功能分析、蛋白相互作用分析.结果:对差异基因筛选后,将两个数据集的数据取交集后终得到303个基因,其中31个基因上调与细胞周期(Cell Cycle)和卵母细胞分裂有关,说明在肿瘤发生发展的过程中,通过上调这些基因促进肿瘤增殖.而其余基因的KEGG分析结果则表明这些基因与代谢过程密切相关.通过蛋白互作网络(PPI)筛选出cross-talk基因:整合素a1(Itga1)和整合素a6(Itga6).结论:筛选出的差异基因可能在舌癌的分子层面发挥了重要的作用,为舌癌发生、发展的机制、肿瘤标志物的筛选等提供了理论依据.
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